Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF839A8K0R7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms