Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV6-7A0A0A0MS04 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV6-7A0A0A0MS04 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV6-7A0A0A0MS04 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV6-7A0A0A0MS04 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV6-7A0A0A0MS04 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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