Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF7Q9UBF6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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