Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HCN3Q9P1Z3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms