Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms