Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NECTIN3Q9NQS3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms