Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM4Q9C037 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms