Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM55Q9BYV6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms