Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms