Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms