Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71DQ8N9W8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms