Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PLD3Q8IV08 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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