Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PPFIBP1Q86W92 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms