Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TYW3Q6IPR3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TYW3Q6IPR3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TYW3Q6IPR3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TYW3Q6IPR3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TYW3Q6IPR3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TYW3Q6IPR3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TYW3Q6IPR3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TYW3Q6IPR3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TYW3Q6IPR3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TYW3Q6IPR3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TYW3Q6IPR3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms