Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms