Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms