Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms