Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms