Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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