Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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