Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FMODQ06828 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms