Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRG3P56975 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRG3P56975 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NRG3P56975 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms