Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EMP3P54852 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EMP3P54852 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EMP3P54852 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMP3P54852 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMP3P54852 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMP3P54852 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms