Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
APCP25054 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
APCP25054 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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