Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRG2P13727 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRG2P13727 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRG2P13727 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms