Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM225BP0DP42 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM225BP0DP42 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM225BP0DP42 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms