Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms