Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDR42E2A6NKP2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms