Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRRTQ9BXP5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms