Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms