Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 KCNMB1-201ENST00000274629 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SHOX-203ENST00000381578 3757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 WFS1-202ENST00000503569 3255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PRAC1Q96KF2 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 ITIH1-201ENST00000273283 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PRAC1Q96KF2 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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