Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF128Q8TEB7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF128Q8TEB7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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