Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS8Q8N3P4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms