Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms