Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms