Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RTL8BQ17RB0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RTL8BQ17RB0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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