Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC6Q16204 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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