Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUM3Q15397 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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