Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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