Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2A2P52657 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2A2P52657 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms