Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC24DO94855 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC24DO94855 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms