Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms