Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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LINC00587B1AMM8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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LINC00587B1AMM8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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LINC00587B1AMM8 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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LINC00587B1AMM8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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