Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF839A8K0R7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms