Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT52Q9Y366 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms