Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms