Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 495.3 ms