Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCOLN3Q8TDD5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms