Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms