Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP10Q15642 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms